故事发生在上世纪三十年代的老上海。辖区发生一起綁架案，探长钟朗（钟汉良 饰）从智障小孩阿定的只言片语中断定，作案人是两年前出现过的掘墓人，由于当时探员宁二昆（赵毅 饰）的疏忽，曾造成廖家两兄弟双双死亡的惨剧。为获取更多线索，钟朗央宁二昆找廖老爷给儿子开棺验尸，果然从中掌握了新的证据，正在这时，法医于胜男（齐芳 饰）和探员韩非（释小龙 饰）遭掘墓人绑架。通过梳理分析，屠宰场老板的养子朱国梁（许贺 饰）进入了钟朗的视线，朱因家父向廖家举债未果自杀，性格偏执的朱国梁干起了报复有钱人的勾当。钟宁二人连手营救于胜男和韩非，结果宁二昆和朱国梁在枪战中双双陨命。从此，掘墓人销声匿迹，不料，在新娘刘秀珠（刘子菲 饰）的婚礼上，怪事又出现了......
《铁齿铜牙纪晓岚3》由“好女争锋”、“假作真来真亦假”、“江湖江湖”、“辨奸计”和“胭脂红”五个单元故事组成。故事由神秘的江南女子陆琳琅（张庭饰）的出现而变得一波不平一波又起。陆姑娘深受乾隆（张铁林饰）宠爱，暂住纪晓岚（张国立饰）府上。然而和珅（王刚饰）早知陆姑娘身世，为斩草除根，多番设计陷害陆姑娘。幸得纪晓岚解救，并一洗陆家冤情。然而这三个老男人却都陷入了儿女情长的重重矛盾中，本不平静的京城更是风波不断。由“铁三角”张铁林、张国立、王刚主演的系列电视剧《铁齿铜牙纪晓岚》，至2009年已发行四部。作为该系列电视剧的第三部，本剧集不仅由这三位老戏骨继续联袂演绎，更在人物关系的设定上，邀请台湾笑星张庭出演神秘女子陆琳琅，为本剧增色不少。
香港毒品犯罪高科技化，卧底修浩潜伏在毒枭邱阵安身边多年，伺机搜集罪证。长期对家庭亏欠，让妻子提出离婚，修浩陷入卧底与家庭破碎双重困境。最终他牺牲个人，和队友剿灭贩毒网络，也让妻儿知道自己多年的正义付出。
在喧闹都市中，有一家隐匿在榕树及湖边的老糖水店“糖大侠”，店主叫唐嘹天，爱聊天爱吹水，已步入花甲之年，做的一手传统好糖水。因为店比较隐蔽，来的基本都是老邻居和熟客，大家都很喜欢这里的气氛，像在朋友家做客一样。人称天哥的他乐在其中，并保留传统经营方式，相信口口相传的力量，彷佛忽略了时代的变迁，这里有一份特殊的静谧和缓慢节奏。但随着暑期来临，在外地求学的孙子唐好好突然返乡，来到糖水店提出要勤工俭学，身为爷爷的唐嘹天虽然知道这个小档口完全不需要帮工，但这样特殊的爷孙关系让他只能答应，并且还得接受唐好好提出的一系列无理要求。