就读于东京都内私立高中的高一学生护郎，既没有「希望」、「梦想」，也没有「野心」，世界对他来说是「冷漠」的东西，一边对同班同学穗香抱有淡淡的憧憬，一边和好友秋津过着毫无变化的无聊的日常生活。有一天，护郎的智能手机收到了奇怪的通知。你被选中了。请注入你的愿望。护郎被选为“伟大的意志”，为了实现愿望，他将登上“神明”的宝座，与其他神明候选人们互相残杀，直到成为最后一人。
新一季将聚焦2001年美国炭疽攻击事件，该事件是在美国发生的一起从2001年9月18日开始为期数周的生物恐怖袭击。从2001年9月18日开始有人把含有炭疽杆菌的信件寄给数个新闻媒体办公室以及两名民主党参议员。这个事件导致五人死亡，17人被感染。直到2008年最主要的嫌疑人才被公布。金大贤饰演一名擅长微生物学的FBI特工，戈德温饰演一名陆军生物学家，该角色根绝真实人物布鲁斯·艾文斯的经历改编。
从俄罗斯押送回国的贪污犯詹明辉及两名俄罗斯警察被人半路劫杀，焚尸灭迹。舒雅和叶聪发现疑点，查明是詹明辉假死脱身的把戏。为找詹明辉，叶聪深入虎穴，危在旦夕。中俄警方赶到，救出叶聪，将詹明辉抓捕归案。
卧底探员陈凤翔（陈小春 饰）在破获一宗社团大案之后，转任文职八年被反黑组重新招回。由于江湖上最令人头痛的黑社会头目正是陈凤翔当年的小弟张志强，陈重出“江湖”，加入以张少钧（陈国坤 饰）为首的反黑B1-1组与新晋恶棍展开周旋，其中不乏昔日好友与仇家，令陈一度进退两难，好在陈与队友在合作期间培养出互信默契。正值香港回归还有三年，黑帮打算乘势大干一票。陈在调查一宗龙头棍的失踪案件时，却发现了涉及香港黑社会百年历史的惊天大阴谋。