影片讲述了在一个没有被历史所记载的朝代，因为它很短，而在这短短的十余年中，相传勾陈大帝留在凡间用来镇妖封煞的镇妖石被天火所毁，百妖肆出，从此举国上下都在忙活着研究同一件事儿，如何降妖。影片不仅呈现出了中国传统文化的艺术魅力和现实主义，还通过人和妖两族的争斗，暗喻了人和大自然之间的关系。
三个底层的小人物：过气的电影演员大花朵，生活不尽人意的酒吧服务员小鸟，被投资人骗财骗色的文艺女青年爱玲。三个女孩因为打抱不平，显露出特质，而被大葱征招为特工，并且在抓捕罪犯豪哥的行动中不小心打破上古神器玉磬，被神器发出的光线带到了古代。大花朵和大葱穿越到了古代的青楼，为了生存，两个人不惜将现代夜店的促销花样搬到了青楼，使得青楼生意火爆，门庭若市。爱玲和小鸟穿越到了皇宫之中，不经意间，两个人陷入了一场危机四伏的宫斗之中。最令人想不到的是豪哥居然穿越成了古代的反王，一心想着篡位登基。几个不靠谱的人把古代搅得天翻地覆，最终邪不胜正，回到现代后豪哥终于被抓
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中