迈克·斯特吉斯和他的弟弟罗伊，被以捏造的火车抢劫罪判处押解到尤马监狱。两人都忍受着残酷的对待，然后迈克逃走了，报复他们的敌人。
在近代日本坊间流传着这样一个传说，名叫岛礼子的美丽少女被美国大兵轮奸，在此之后她精神失常，卧轨而死。岛礼子一缕幽魂不散，化作只有上半身的恐怖恶灵。它极端憎恶红色，每晚出没在横跨铁路的天桥上，并在路过之人背后发出“嗒卡嗒卡”的声音。一旦路人回头，它便将对方拦腰斩断。即使侥幸逃过，在接下来的72小时内也必然遭到“嗒卡嗒卡”的猎杀。 高中少女大桥可奈（大岛优子 饰）的好友绫花夜归遭遇“嗒卡嗒卡”，遇害身亡。克奈在祭拜好友时，同样见到这个恐怖恶灵，不过侥幸逃脱。然而死亡的阴影仍然笼罩在她的头上，在女大学生平山理绘（山崎真实 饰）的帮助下，她们一同出发寻找求生的办法……
电影讲述了报社记者、业余网络悬疑故事作家追查十年前发生在“谜镇”的几件知名鬼事的真相，根据匿名电话来到了所有传闻最早开始的地方，而十年过去后，这个地方因为闹鬼已经成了无人居住的鬼楼。随着真相慢慢揭开，他自己似乎也陷入了危险之中……《恐怖笔记》打破常规恐怖电影叙事模式，采用笔记类多线叙事风格，以笔记本为载体、笔记类章节式呈现，将“后视镜”、“宾馆浴室”、“公交车”、“可视门禁”五个群像众多的繁复线索有机串联，重力打造出“笔记未完，恐怖不绝”这一极致恐怖体验，力求强化群像人物设定之间的纠缠和影响。
描绘福岛的现在，再平常不过的相遇的故事。这个世界，仍然有爱。